Der tierärztliche Dienst ist wie folgt organisiert: Für die fachlichen Belange in Lehre, Forschung und Dienstleistung zeichnen die Abteilungsleitenden verantwortlich. Für den Spitalbetrieb und dessen reibungslosen Funktionieren und die Koordination der verschiedenen Dienste zeichnet der Ärztliche Leiter verantwortlich. Alle Tierärzte, welche "on-clincs" sind, sind dem Ärztlichen Leiter, Prof. David Spreng, unterstellt. Die Kleintierklinik beschäftigt rund 40 Tierärzte und Tierärztinnen, darunter auch vier Belegtierärzte für die Spezialgebiete Augenheilkunde, Verhaltensstörungen, Zahnheilkunde und Akupunktur.

Die Koordination der Klinikabläufe, welche den Support der Anästhesie benötigen, erfolgt durch die medizinisch-technischen Mitarbeitenden der Abteilung Anästhesiologie. Täglich finden Koordinationsmeetings statt, an welchen alle Abteilungen teilnehmen.

Wöchentlich finden gesamtspitalweite "Grand Rounds" statt, in denen komplexe Fälle vorgestellt oder spezifische veterinärmedizinische Themen behandelt werden. Diese interne Weiterbildung dient u.a. der Qualitätssicherung und -entwicklung.